In 1940 wordt Nederland bezet door de soldaten van Adolf Hitler. Niet de Nederlandse driekleur, maar de vlag met het hakenkruis wappert boven Nederland. Deze omnibus begint met de belevenissen van de joodse jongen Jaap Rozeboom, die moet onderduiken omdat hij zijn leven niet meer zeker is. Wanneer hij terechtkomt in het gezin van boer Kooiman, sluit hij vriendschap met Chris, de zoon van boer Kooiman, en zijn vriend Jan Blankers. Samen beleven ze veel avonturen. 'Holland onder het hakenkruis' is niet alleen een spannend verhaal, het geeft ook een heel duidelijk beeld van de omstandigheden en gebeurtenissen in oorlogstijd. In deze omnibus is voor het eerst ook de voorloper 'In nacht en stormgebruis' opgenomen.